銅綠假單胞菌是條件性致病菌,危害人類身體健康。近日,在銅綠假單胞菌中報道了一個新型的轉錄因子SutA(survival under transition A)。SutA對于維持細菌厭氧條件下的基因轉錄至關重要。SutA突變會造成各種缺陷的表型,例如,生物膜形成能力降低、致病毒力下降等。生化和遺傳數據表明SutA調控細菌內大多數基因表達,尤其是核糖體合成相關的基因,但其作用機制尚未得到解析。
7月21日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所/中科院合成生物學重點實驗室張余研究組與浙江大學醫學院馮鈺研究組合作,在《自然-通訊》(Nature Communications)上,在線發表了題為Pseudomonas aeruginosa SutA wedges RNAP lobe domain open to facilitate promoter DNA unwinding的研究論文。該研究揭示了SutA激活銅綠假單胞菌RNA聚合酶轉錄的新機制。研究解析銅綠假單胞菌中SutA和RNA聚合酶的復合物冷凍電鏡結構發現,SutA能夠通過RBD結構域錨定在RNAP的protrusion結構域,而通過wedge loop(WL)擠入protrusion和lobe結構域的縫隙,誘導lobe結構域的往外旋轉,進而擴大RNA聚合酶結合DNA的通道,促進RNA聚合酶和雙鏈啟動子DNA的結合。該成果揭示lobe結構域的開關可以控制RNAP聚合酶結合DNA的能力,且SutA通過固定lobe的打開構象促進RNAP的轉錄活性。
研究工作得到中科院戰略性先導科技專項、國家自然科學基金和上海市科學技術委員會“科技創新行動計劃”的支持。
SutA激活RNA聚合酶轉錄活性的模式圖